木质托盘熏蒸主要有两种方法：热处理法和溴甲烷熏蒸法。
热处理时，木质包装箱经处理后，木材中心温度应达到56℃，并保持至少30分钟。
熏蒸时，木质包装必须在规定剂量的溴甲烷密闭处熏蒸至少16小时，然后放置在通风处，将熏蒸剂浓度降至安全浓度以下。
以上处理后，最好在木箱包装的每件商品的可见位置、每件商品的两侧，都有一个清晰、的标志。该标志需经国际植物保护公约认可，以证明木质包装已进行了规定的处理。标记必须包括ippc特殊标记、iso标准代码、植物保护局发给木质包装制造商的编号以及代表处理方法的缩写。免熏蒸托盘产品一般符合世界各国的入境和环保要求，无需任何手续即可在进口国直接清关。
免熏蒸托盘(消毒)有两种方法，即用药和热处理。使用的药物是溴甲烷和环氧乙烷
1.将要熏蒸的货物按顺序堆放，用篷布盖住，四面压实密封，但留一个角落给加药口。
2.把一盆清水放在篷布下面和货物旁边，把药放在水里
3.预留加药口应压实，使需要熏蒸的货物保持24小时全密封状态
4.打开篷布通风，待毒气排尽后，移动货物，大约18-24小时
5.出具免熏蒸木箱(消毒)合格证。